จากการที่หลายฝ่ายมีความกังวลว่า การติดต่อแลกเปลี่ยนอย่างใกล้ชิดระหว่างสองฝั่งช่องแคบไต้หวันจะทำให้พันธุ์พืชและเทคโนโลยีทางการเกษตรรั่วไหลนั้น คณะกรรมการการเกษตร สาธารณรัฐจีน(ไต้หวัน) เตรียมใช้มาตรการควบคุมที่มีความเข้มข้นมากขึ้น อาทิ “ห้ามจำหน่ายกลับมายังไต้หวัน” “คุ้มครองตลาดเป้าหมาย” และ“เพิ่มรายการควบคุมกล้าพันธุ์พืชและลูกพันธ์สัตว์”เป็นต้น ทั้งนี้เพื่อเป็นการเพิ่มความคุ้มครองพันธุ์พืชและสัตว์ของไต้หวัน เพื่อรักษาศักยภาพการแข่งขันของภาคการเกษตร